Neben dem vielfältigem Programm an regulären Schulprojekten, Nachmittagsprojekten und Ferienprojekten ist das musiculum Kooperationspartner oder Trägerin besonderer weiterer Projekte. Zu nennen sind hier aktuell das Projekt Kiel MusiX, die Kulturkiste sowie ab Anfang 2017 das musiculum MOBIL.